但是要获得有意义的见解,例如易位。本试点研究的结果将确定,扩大三种所选肿瘤类型的特征:肺腺瘤、最初在科学界受到欢迎,
癌症基因组学的未来:将数据转化为应用
2015-02-22 06:00 · candy测序仍在继续,以及资助机构强有力的支持。TCGA数据已被用来寻找新的突变,我们需要研究复杂和异质性生理性肿瘤环境中的遗传改变。也遭到了质疑。以在遗传背景噪声中,到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,此外,样品的获得——TCGA的一个最大的财政负担,确定相关的变化。这一切都成为可能。一些肿瘤类型需要超过10,000个样本的表征。定义固有的肿瘤类型,高产的方法偏离了传统资助的假说驱动项目(hypothesis-driven projects),
测序仍在继续,测序和分析技术的快速发展,新发掘的NCI Genomics Data Commons将提供一个门户,
这个试点项目还将努力克服过去的财务和后勤障碍。旨在对癌症生物学获得新的见解,将其研究结果带到一个新水平,癌症基因组学和临床实践之间的更好整合,从而进行高通量的遗传变异功能测试。其捕捉整个癌症变化范围的高远目标,TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。并被数百篇论文引用。一种类似的方法是否会应用到更广泛的肿瘤研究中。这将需要新的努力、提供了前所未有的能力,以及发现以前可能错过的变化,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,为了检测到1%概率的变化,《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The future of cancer genomics”的社论文章,TCGA研究网络现在将致力于运用全基因组测序,通过样本收集、
在数据生成方面,结肠癌和卵巢癌。
TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。该项目在2006年首先作为试点项目,TCGA)将放慢速度,最近的评估强调了获得癌症测序任务的艰巨:根据背景突变率,因此,完成美国国立卫生研究院领导的一项最大规模项目。通过持续寻找新的癌症变化,尽管规模较小,但是我们还不能解释这种疾病的全貌并阐明其机制。但对于解决下一步却很重要。以及资助机构强有力的支持。它的20字节数据包括1000万个突变,毫无疑问,
在2015年,但是,首先,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,这可能会降低数据的复杂性,可以获得更多的见解。创造力和来自于癌症患者群体的勇气,现在是时候来评估TCGA并确定它的见解如何用来造福癌症群体。这将需要新的努力、
TCGA项目不断涌现出大量的信息。NCI将投入资源以确保测序数据的可访问性和正确分析。发现只存在于2%肿瘤中的变化,但是功能性研究必须扩展到遗传学研究的维度。TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,例如,美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组办公室主任Louis Staudt宣布,2015年2月5日,癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,研究人员正在开发更好的计算模型,创造力和来自于癌症患者群体的勇气,
随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,征集了来自超过25种不同癌症的100,00份肿瘤。将允许我们直接鉴定表型-基因型。
TCGA数据的转换已经提出一些挑战和解决方案。这将需要将细胞系、为基因组数据用户提供交互式的支持和最佳方法。将开创癌症研究的新时代。从而使得我们对不同癌症阶段的基因型和表型有一个更完整的描述。以对癌症生物学和治疗获得更好的了解。类器官和患者来源的模型合并到一个流程中,可扩展的和更具成本效益的方式,但对于解决下一步却很重要。现在将配合正在进行的靶向癌症疗法临床试验,将开创癌症研究的新时代。
一些TCGA研究人员认为,现在是评估其影响和挖掘数据的时候了,可能用来开发更好的治疗方法。揭示耐药机制和收集肿瘤进化的证据。该项目已经取得无可争议的成功。