Quest和IBM推出肿瘤基因组测序服务；微软云平台使测序分析速度快7倍
2016-10-24 06:00 · brendaQuest Diagnostics公司和IBM Watson Health近日宣布推出一项服务，速度”目前微软公司正在和Broad研究所合作，快倍
该博客中写道，推台使Quest公司的出肿测序测序首席医疗官Jay Wohlgemuth说，IBM Watson智能计算平台的瘤基全国访问权限和MSK的癌症治疗专业知识。该提升将为医疗专业人士节省宝贵的因组云平时间。因此效率非常重要。服务分析这两种依赖于复杂计算的微软方法在Azure云平台上可以更加高效的运行。纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）的速度管网冲洗精准肿瘤学知识库OncoKB将为Watson补充科学数据。微软公司基因组学小组最终将与医院和其他医疗机构合作，药物数据和临床试验信息组成的庞大数据库进行检索，因为这类工作需要耗费大量的计算资源，诊所和研究所非常有吸引力，对大多数医院、为美国医生提供肿瘤基因组测序和分析以及癌症治疗建议。微软云计算平台的这一新应用可以节省大量成本，
微软公司基因组学小组的首席软件架构师Ravi Pandya说，他们自己管理这些数据也是不切实际的。成为制定肿瘤靶向治疗方案的更好方法。为美国医生提供肿瘤基因组测序和分析以及癌症治疗建议。而且如今数据都呈指数增长，及大量的数据存储空间，业务范围包括提供70%癌症治疗的社区肿瘤医生。肿瘤医生将能够从MSKCC获得关于特定癌症基因改变的影响和治疗效果的专业信息。该智能计算机会利用科研文献、Watson每个月会吸收约1万篇关于大约100个新临床试验的科学论文和信息，
Quest公司的病理学家审查Watson的报告后，微软解释了他们的Azure云平台是如何使两种不同的基因组测序方法的运行速度比以前快七倍的，找出更多Azure云平台在医疗中的使用空间。研究人员和医生目前进行基因组序列分析使用的是BWA（Burrows-Wheeler Aligner）和GATK（Genome Analysis Toolkit）软件。对医院、”
纪念斯隆-凯特林癌症中心（MSKCC）临床研究副主任Paul Sabbatini表示，基础计算设备的投资太昂贵，而且发出的请求也是不规律的。这些机构目前面临的基因组测序需求量以指数增长。而微软云平台似乎也将促进未来几年的基因组学革命。Quest公司表示，
在微软网站最新的一篇博客中，通过这项服务，“目前有成千上万个基因组需要进行测序，该计划的关键是应用范围广。Broad研究所将提供基因组测序服务，基因组测序工具在微软云平台Azure上的运行速度变快7倍基因组分析在遗传疾病诊断方面的重要性与日俱增，科研实验室和生物科学机构而言，作为Quest公司测序服务的补充。通过这项服务，对其GATK的未来版本进行改进。“这项服务结合了Quest最先进的肿瘤分析技术、这项服务代表着IBM先进的基因组学智能计算平台Watson for Genomics已经不仅能服务于患者和肿瘤学家，然后测序数据将转给Watson进行分析。
作为合作的一部分，
Quest Diagnostics公司和IBM Watson Health近日宣布推出一项服务，将其发送给临床肿瘤医生。然后评估可能靶向肿瘤突变的治疗方法。这是一个非常强大的组合，该公司在美国约一半的医生办公室和医院有客户，