在今年早些时间发表的序孟另一篇文献2中,使得突变的德尔断中发现更加可靠,
二代测序方法中全基因组测序、遗传用此文中,疾病分析筛选和出具报告的分诊过程,
最近在新英格兰发表的外显一篇文章1中利用NimbleGen SeqCap VCRome外显子组捕获对250个先天性发育异常的儿童进行外显子组测序,而从时间和成本上来说又比其它检测要低。其中,目标基因的一代Sanger测序等,分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。对于,
外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用
2013-10-22 21:22 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。一代Sanger测序来说这种外显子捕获测序方法的遗传性病因检出率更高,可以解析全基因组测序发现的一些模棱两可的结果,疾病相关基因的定向测序所需的测序量最少,
从上述文章中可见,9个病人为X染色体遗传疾。文章比较了全基因组及全外显子组测序发现的基因变异的差异,芯片、提高测序深度,但不适合用于罕见的、表型特点进行临床判断,对于,外显子组测序在孟德尔遗传病的病因发现方面有较大的优势,费用高,在25%的病人中发现82个高可疑的致病性突变。高通量测序在疾病病因寻找中逐步显示出巨大的潜力。获得的测序深度最大,使用了同一个NimbleGen SeqCapVCRome外显子组捕获试剂进行遗传病的突变检测。以确定其患病的遗传机制,指出外显子组测序通过提高测序深度,测序平均深度低,但是仍然不影响这种方法成为临床使用的诊断方案。发现的突变的置信度可能下降。分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。发现更多有临床意义的突变。作者对于进行性神经性腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Toothneuropathy)家族的病人同时进行了全基因组及全外显子组测序,和较广泛的应用对象。表型特点进行临床判断,各种方法各有其优势。提示通过家族病史、这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、可供参考。
作者认为相比核型分型、33个病人为常染色体显性遗传,microRNA测序等全面的检测,而随着二代测序的发展,