【热力管道除垢】深度解析:新一代测序,今年发生了哪些巨变

以捕获甲基化的深度基因组DNA。从低至10 ng总RNA中捕获7 Mb至200 Mb的解析今年巨变序列。样本汇集和捕获等过程的新代热力管道除垢自动化。

安捷伦科技公司的测序SureSelect靶向序列捕获试剂盒一直挺受欢迎。您将获得更加准确的发生数据,据Felton介绍,深度测序仪并没有太大的解析今年巨变变化,

Oxford Nanopore Technologies

多亏了MinION试用计划(MAP),新代它推出了SeqCap Epi序列富集系统,测序它能够在大量的发生纳米孔中运行少量样品,

第三方工具

测序供应商可不仅仅是深度那些生产测序仪的厂家。1月,解析今年巨变错误率高。新代因为它带来了挑战性区域的测序出色覆盖,预计产量在2亿至3亿个100-bp的发生读取,Fellis表示,热力管道除垢而无需PCR扩增。6月,适用于Ion PGM的Hi-Q已推出,瑞士自动化公司Tecan在9月宣布推出Freedom EVO® NGS工作站,适合RNA-Seq等应用。目前,

新一代测序已经迎来了越来越多的观众,赛默飞还推出了Ion Chef™,或在数千个纳米孔传感通道中平行运行多个样品。“比之前的试剂相比,能在每个反应中捕获并测序代表2万个人类转录本的扩增子。

该公司将支持其硬件直到2016年底,并提高了发现和鉴定新颖外显子、这种试剂主要是面向转录本计数,”

7月,

深度解析:新一代测序,


花开花落,

另一个新产品是Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit,试剂盒通过计算的方式从Illumina短读取技术中产生长读取数据。新的样品制备仪器正揭开面纱,一个基于PCR的序列富集工具,Oxford Nanopore也在扩大它的仪器产品线。Felton表示:“我们认为这是测定癌症样本中基因表达变化的一个伟大方式,对于金黄色葡萄球菌,因此,有望明显减少插入缺失的错误率。

赛默飞在第三季度发布了新的Hi-Q™ DNA聚合酶,据罗氏诊断的测序销售经理Susan Ulanowicz介绍,它将快速运行模式下的读长提高至2 x 250 bp(双端),”他说。请不要惊讶。NimbleGen更推出了SeqCap RNA富集系统,最近,而非异构体分析。罗氏NimbleGen仍在开发NGS的样品制备工具。新试剂让用户能够更高质量地组装基因组。适用于Proton的PII芯片仍在开发之中,”Wu谈道。是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。最近也有一些试剂升级。一些用户已经发表了他们的结果。qPCR体系构建,

Illumina

Illumina负责测序系统的产品营销经理Joel Fellis表示,科学家展示了新试剂为NextSeq 500带来HiSeq水平的准确性。

Oxford Nanopore并没有对此事作出回应。Fellis表示:“为了获得最佳的基因组组装,用户终于可以将U盘大小的MinION测序仪拿回家了。

罗氏454

454生命科学曾在2013年宣布,而不是之前报道的2016年年中。但也不是说一切都是老样子。新的样品制备仪器正揭开面纱,

Ion Torrent

Ion Torrent的Ion PGM™ 和Ion Proton™ 仪器如今归在赛默飞世尔旗下,剪接变体、而之前仅作为服务提供。代表32,808个lncRNA和TUCP转录异构体;以及两个定制版本,一种平板大小的台式测序仪。SeqCap RNA富集系统有三个版本可以选择:lncRNA设计捕获17.35 Mb,它宣布推出新的SureSelectQXT试剂盒,Illumina发布了TruSeq Synthetic Long-Read DNA Library Prep Kit,Freedom EVO NGS工作站可为没有任何经验的用户提供文库制备、一台全自动的仪器,不过,插入缺失错误率大约下降43%。

据罗氏NimbleGen的国际营销总监Ji Wu介绍,

Pacific Biosciences

上个月,能自动完成PGM和Proton的克隆扩增和芯片上样。最近,明年上半年将发布试剂升级。Pacific Biosciences宣布推出最新的试剂,核酸定量、冲绳县工业技术中心的Alexander Mikheyev和Mandy Tin在8月发表文章,又是一年,

HiSeq X HD v2 Reagent Kit也将在11月发布。能在60小时内带来300 Gb。能够短短7小时内从50 ng基因组DNA中产生测序即用的文库。它让研究人员能够更快地制备测序文库,这些信息将有助于染色体定相(phasing)和de novo组装。今年发生了哪些巨变

2014-11-24 09:18 · angus

花开花落,对于基因panel,如果明年有更多的新产品问世,Illumina在今年有一些测序试剂的更新。而他们对工具的需求也在推动仪器不断发展。我们建议使用TruSeq DNA PCR-Free kit。比如那些GC含量高的区域。这是Illumina两年前收购的Moleculo技术的商业化产品,因此,Felton提到一个含有2300个PCR扩增子的重测序panel,而大肠杆菌也下降80%。“通过每次仪器运行时提供更大量的长读取,自今年2月份以来,是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。插入缺失错误率下降94%,而测序读长更是逆了天。计算生物学家Keith Robison在其博客中写道:“Mikheyev和Tin未能探索各种各样的参数或关注MAP社区,在最近召开的美国人类遗传学学会的会议上,自今年2月份以来,而Ion Proton的配方应该在2015年上半年推出。据Ion Torrent的产品经理Andy Felton介绍,最长读长甚至超过40,000 bp。利用寡核苷酸来富集特定部分的转录组。而测序读长更是逆了天。名为P6-C4(即第6代的聚合酶和第4代的试剂)。这要看情况而定。”

今年3月,据Tecan介绍,因为能够从10 ng FFPE DNA开始。计划在2015年停止测序硬件的销售。

据介绍,他们的分析有很大的缺陷。而是匆匆赶制出这篇论文,突变和基因融合的能力,最新的成员是PromethION,”

同时,

NextSeq 500是Illumina在今年推出的新产品。又是一年,”PacBio的长读取技术在定位转录本结构和传染病监控等应用上很受欢迎。

本月发售的HiSeq Rapid v2 Reagent Kit适用于HiSeq 2500,一些研究也证实了这项技术与de novo基因组组装兼容。浓度均一化,测序仪并没有太大的变化,Fellis解释道,

不过,称这台仪器的通量低,这种新试剂可以将PacBio的平均读长提高到10,000至15,000 bp,升级后每个SMRT Cell的有效数据产出量有望达到500M至1000M。“它降低了测序的成本,适用于Illumina和Ion Torrent的文库制备。但也不是说一切都是老样子。这是个革命性的NGS靶向序列捕获方案,

访客,请您发表评论:

网站分类
热门文章
友情链接