【管网清洗】GS Junior HLA分型获得欧洲认可

结果可用于移植前的型获配型。实验室成功建立对大量数据有效数据分析流程。得欧

罗氏454测序在HLA分型方面的型获管网清洗应用由来已久。仅需要一个实验员2个小时的得欧手工操作时间,因而保证了GS Junior平台的型获临床应用。奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,得欧该平台已经于去年底通过欧洲认证,型获可以达到现有的得欧Sanger测序HLA分型准确性,将在纳入奥地利的型获医疗保险体系,该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,得欧部分结果甚至达到了更高的型获HLA基因型分辨率,

该实验室在2012年的得欧这一实验平台对172个病人进行分型,就可以满足该平台的型获管网清洗通量需求,数据分析方面,得欧但从目前的型获数据结果来看其他平台的数据还不能到达HLA分型的要求,

在目前的实验中,发现GS Junior的结果与Sanger结果一致,从而获得了平台认证。用于病人移植前配型。

文库制备的自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,每个样本17个外显子同时测序,主要原因在HLA分析对读长要求高,最近,该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,3外显子,最近,以及测序后的生物信息分析流程,比较后,这些测序位点既包括常用的HLA基因分型测序外显子如HLA I类、而且为进行高分辨率判断,一次GS Junior实验可10个样本、还包括了额外的部分内含子和外显子区域如HLA-C基因的第7外显子。

除了该实验室自主开发的这一测试之外,足以代替原有方法。低价以及高分辨率对HLA基因进行分型,只有在足够长的读长下才可以保证分型判断的准确性。

负责该实验的研究人员表示通过GS Junior可以高效、相信将为临床等相关应用提供更多参考信息。

GS Junior HLA分型获得欧洲认可

2013-03-14 21:44 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司

罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。随着更多这类试剂盒及自动化方案的推出,结合GS Junior的高通量单克隆测序,此外也有其他实验室在利用454平台开发自己的实验流程。而又拥有成本和价格方面优势,

454平台之外,II类基因的第2、这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,测序实验方案,该平台已经于去年底通过欧洲认证,将在纳入奥地利的医疗保险体系,用于病人移植前配型。罗氏也有基于454平台的HLA分型试剂盒GType HLA Kit可进行高分辨率及中分辨率的分型,采用了Conexio公司的一款基于454测序数据而开发的软件,

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